Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms