Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMF1P82094 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMF1P82094 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms