Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms