Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms