Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPFP49454 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPFP49454 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPFP49454 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPFP49454 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPFP49454 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPFP49454 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPFP49454 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPFP49454 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPFP49454 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPFP49454 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPFP49454 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPFP49454 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPFP49454 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPFP49454 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPFP49454 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPFP49454 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPFP49454 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPFP49454 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 392.6 ms