Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5OP48047 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms