Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP5P45974 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP5P45974 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP5P45974 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP5P45974 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP5P45974 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP5P45974 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP5P45974 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP5P45974 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP5P45974 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP5P45974 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP5P45974 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP5P45974 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP5P45974 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP5P45974 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms