Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms