Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms