Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms