Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMPD1P23109 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms