Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTPS1P17812 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTPS1P17812 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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