Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PRG2P13727 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PRG2P13727 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PRG2P13727 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PRG2P13727 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PRG2P13727 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PRG2P13727 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PRG2P13727 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PRG2P13727 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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PRG2P13727 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PRG2P13727 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PRG2P13727 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PRG2P13727 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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