Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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