Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UPP2O95045 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UPP2O95045 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UPP2O95045 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms