Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PPFIA3O75145 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPFIA3O75145 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms