Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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C4orf47A7E2U8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C4orf47A7E2U8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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