Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNRF3Q9ULT6 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms