Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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