Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MBD5Q9P267 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms