Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms