Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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