Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms