Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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