Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHACTR1Q9C0D0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms