Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CIPCQ9C0C6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CIPCQ9C0C6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CIPCQ9C0C6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIPCQ9C0C6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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