Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR345-201ENST00000362114 98 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LCN12-202ENST00000371633 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms