Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GABARAPL3Q9BY60 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms