Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PACSIN1Q9BY11 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PACSIN1Q9BY11 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms