Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RNF17Q9BXT8 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RNF17Q9BXT8 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RNF17Q9BXT8 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RNF17Q9BXT8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RNF17Q9BXT8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RNF17Q9BXT8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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RNF17Q9BXT8 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF17Q9BXT8 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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