Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRIP3Q9BW71 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms