Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms