Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NICN1Q9BSH3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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