Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms