Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PMCHL2Q9BQD1 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms