Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PKP4Q99569 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PKP4Q99569 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PKP4Q99569 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PKP4Q99569 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PKP4Q99569 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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PKP4Q99569 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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