Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD8Q96LT4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms