Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms