Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSPRY1Q96DX4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms