Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LINC00269Q8N2A0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LINC00269Q8N2A0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LINC00269Q8N2A0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LINC00269Q8N2A0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LINC00269Q8N2A0 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LINC00269Q8N2A0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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LINC00269Q8N2A0 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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LINC00269Q8N2A0 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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LINC00269Q8N2A0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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LINC00269Q8N2A0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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LINC00269Q8N2A0 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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LINC00269Q8N2A0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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LINC00269Q8N2A0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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