Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPAS3Q8IXF0 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms