Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNMB4Q86W47 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNMB4Q86W47 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms