Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PBRM1Q86U86 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms