Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDXQ7Z353 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms