Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms