Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms