Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTE2Q6XPS3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms