Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms