Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms