Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms